在口袋妖怪：火红的一周目游戏进程中，玩家有机会接触并捕获数只传说宝可梦，但这通常与推进主线剧情紧密相关。部分传说宝可梦的遭遇需要玩家先完成击败八个道馆并成为联盟冠军的核心通关目标。在此游戏世界会扩展出新的区域和任务，为解锁更多传说中的宝可梦提供了可能性。一周目内获得传说宝可梦并非纯粹的线性流程，往往需要通关后继续探索。
三只传说中的鸟类宝可梦散布在关都地区及周边岛屿，玩家在一周目后期即可前往定位并尝试捕获。它们分别是急冻鸟、闪电鸟和火焰鸟。急冻鸟位于双子岛的洞穴深处，闪电鸟栖息在无人发电厂的内部区域，而火焰鸟则可以在七之岛的灯火山深处找到。抵达这些特定地点通常需要掌握对应的秘传机器技能，例如冲浪和闪光，以便穿越复杂地形。
除了三圣鸟，通关一周目后，名为三圣兽的传说宝可梦也会在特定条件下出现。其触发条件是在一周目结束后，将关键任务物品蓝宝石交付给特定NPC锦辉。完成这一步骤后，雷公、炎帝、水君这三只宝可梦便会在关都地区与七之岛的广阔地图上随机游走，玩家在野外草丛中有几率遭遇它们。这种遭遇方式较为特殊，需要玩家耐心在各个区域反复移动探索。
游戏中最具代表性的传说宝可梦超梦，其捕获有着明确的硬性前提条件，即必须彻底完成一周目剧情并击败精灵联盟的四天王。达成目标后，位于华蓝市左侧水域的华蓝洞窟才会开启。洞窟内部地形复杂且充满挑战，队伍宝可梦等级建议足够高，并需备好闪光等技能。超梦等级高达70级，位于洞窟最底层，是整个游戏流程中实力最为强劲且最难捕捉的传说宝可梦之一。
不同的传说宝可梦有着各自固定的出现地点或触发机制，无一例外都需要玩家具备相当的战斗准备和探索耐心。例如另一只幻之宝可梦梦幻，在正常游戏流程中无法直接遭遇，这一点需明确。系统性地推进游戏主线与支线内容是成功集齐这些强大伙伴的关键所在。
